Gegründet wurde der Verein wohl 2004. Bis zum Jahr 2006 ist nicht geklärt, in welcher Liga der Verein spielte. In den Statistiken gibt es auch eine Mannschaft aus Chanthaburi, welche 1984 das Finale des Pokals erreicht hat.[1] Es ist nicht zu klären, ob es sich hierbei um denselben Verein handelt. Von 2006 bis 2012 spielte der Verein in der Thai Premier League Division 1. 2012 belegte man den 18. Platz und stieg in die dritte Liga, der Regional League Division 2. Hier spielte man bis 2015 in der Region Central/East. 2016 trat der Eastern Region der Regional League Division 2 an. Seit der neuen Ligareform 2017 spielt der Verein in der vierten Liga. Hier trat man in der Eastern Region an. 2017 wurde man Meister der Region. Die Saison 2020 wurde wegen der COVID-19-Pandemie nach dem zweiten Spieltag abgebrochen. Während der Unterbrechung wurde beschlossen, dass nach Wiederaufnahme des Spielbetriebs die vierte und die dritte Liga zusammengelegt werden. Chanthaburi spielte fortan in der Eastern Region der dritten Liga. Die Saison 2022/23 schloss man als Vizemeister der Region ab und qualifizierte sich somit für die Aufstiegsspiele zur zweiten Liga. In der Upper Region der National Championship wurde man Sieger und stieg direkt in die zweite Liga auf. Das Finale um die Gesamtdrittligameisterschaft wurde gegen den Sieger der Lower RegionMH Nakhonsi City FC verloren.
Der Verein trägt seine Heimspiele in Chanthaburi im Chanthaburi Province Stadium (thailändischสนามกีฬาจังหวัดจันทบุรี หรือ สนาม อบจ. จันทบุรี), auch als Chanthaburi PAO. Stadium bekannt, aus. Das Mehrzweckstadion hat ein Fassungsvermögen von 5000 Personen.