Finnlakeviridae

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Finnlakeviridae

TEM-Aufnahme von Virionen des Flavobacterium-
Phagen FLiP. Balken 100 nm.[3]

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria[2]
Reich: Bamfordvirae[2]
Phylum: Preplasmiviricota[2]
Klasse: Ainoaviricetes[2]
Ordnung: Lautamovirales[2]
Familie: Finnlakeviridae[1]
Gattung: Finnlakevirus
Taxonomische Merkmale
Genom: ssDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 2
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: behüllt?
Wissenschaftlicher Name
Finnlakeviridae
Links
Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions des Flavo­bac­terium-Phagen FLiP (Finnlkeviridae).[3]

Finnlakeviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren, die im April 2023 ihre genaue taxonomisch Zuordnung unter den Preplasmiviricota der Bamfordvirae erfahren hat.[2] Die Familie enthält eine einzige Gattung, Finnlakevirus, und die eine einzige Spezies (Art), Finnlakevirus FLiP (veraltet Flavobacterium virus FLiP). Die natürlichen Wirte sind gramnegative Bakterien, daher werden die Finnlakeviridae nicht-taxonomisch als Bakteriophage klassifiziert.[3][4]

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).[5][4]

Genomekarte von Flavobacterium phage FLiP.[3]
Schemazeichnung eines Virions der Gattung Finnlakevirus, Querschnitt und Außenansicht

Das Genom von Phage FLiP ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Molekül (ssDNA) mit einer Länge von etwa 9,2 kb (Kilobasen).[4]

Die Systematik der Familie Finnlakeviridae ist nach ICTV mit Stand Mai 2024 wie folgt:[6][7]

Familie Finnlakeviridae

  • Gattung Finnlakevirus (monotypisch)
    • Spezies Finnlakevirus FLiP (monotypisch)
      • Flavobacterium-Phage FLiP (englisch Flavobacterium phage FLiP)

Einzelnachweise

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  1. ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. a b c d e f ICTV: Master Species Lists, § ICTV_Master Species List 2022 MSL38.v1.xlsx vom 8. April 2023.
  3. a b c d S. Mäntynen, E. Laanto, L. R. Sundberg, M. M. Poranen, H. M. Oksanen: ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae, in: The Journal of General Virology, Band 101, Nr. 9, September 2020, S. 894–895, doi:10.1099/jgv.0.001488, PMID 32840474, ICTV (Memento des Originals vom 23. April 2021 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org.
  4. a b c ICTV Report Finnlakeviridae. Abgerufen am 23. März 2021 (englisch).
  5. NCBI: Pseudoalteromonas virus PM2 (species)
  6. ICTV: Taxonomy Browser.
  7. ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).