Micromonosporaceae

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Micromonosporaceae

Salinispora arenicola Stamm TM223-S2

Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Abteilung: Actinobakterien s. l. (Actinomycetota)
Klasse: Actinobakterien s. s. (Actinomycetia)
Ordnung: Micromonosporales
Familie: Micromonosporaceae
Wissenschaftlicher Name der Ordnung
Micromonosporales
Genilloud 2015[1]
Wissenschaftlicher Name der Familie
Micromonosporaceae
Krassilnikov[2] 1938
Actinoplanes utahensis, Referenzstamm NRRL B-16727 auf einer Agarplatte.
Kolonien von Actinobacterien in Schräg­agar­röhrchen, hierbei bilden Micromonospora-Arten typischerweise rote Kolonien, Nocardia asteroides (Mycobacteriales) gelbe und Actinomadura madurae (Streptosporangiales) weiße Kolonien (von rechts nach links).

Die Micromonosporaceae sind eine Familie gram-positiver, sporen­bil­den­der Bodenbakterien mit hohem G+C-Gehalt,[3] die ein echtes Myzel bilden. Die Micromonosporaceae sind die einzige Familie der Ordnung Micromonosporales aus der Klasse Actinomycetia (Actinobacteria).[4]

Die Familie umfasst Mikroorganismen, die durch drei Arten von Sporen­strukturen gekennzeichnet sind: Einzelsporen, Sporenketten und Sporangien (Sporenbehälter), die direkt auf den Hyphen des Substrats getragen werden. Die Sporen können unbeweglich oder beweglich (motil) sein, sie besitzen im letzteren Fall polare (endständige) Geißelbüschel.[5]

Die Micromonosporaceae sind aerobe, nicht säurefeste und mesophile (in mittleren Temperaturbereichen lebende) Mikroorganismen. Viele Stämme pro­du­zieren carotinoide Myzelpigmente, die den Kolonien ein orange­farbenes bis rotes Aussehen verleihen; es werden teilweise aber auch blaugrüne, braune oder violette Pigmente produziert.[5]

Das Peptidoglykan (Murein) der Zellwand enthält meso-Diamino­pimelin­säure und/oder 3-Hydroxy-Diaminopimelinsäure.[6][7][8] L-Lysin kann auch als Aminosäure vorkommen. Mit Ausnahme der Pilimelia-Arten ist die erste Aminosäure der Peptidkette bei allen Mitgliedern der Familie Glycin. Hydrolysate des gesamten Organismus sind reich an Arabinose, Xylose und Galaktose, mit variablen Mengen an anderen Zuckern. Die Bakterien produzieren komplexe Mischungen von gesättigten Iso- und Anteiso-Fettsäuren.[A. 1] EinPhospholipid ist Phosphatidylethanolamin (Phospho­lipidtyp II)[5]

Viele Arten bauen Chitin, Cellulose, Lignin und Pektin ab — diese Mikro­organismen spielen eine wichtige Rolle beim Umsatz von organischem Pflanzenmaterial. Darüber hinaus produzieren viele Stämme nützliche Sekundärmetaboliten und Enzyme. Sie haben wichtige Anwendungen in der Industrie, der Biotechnologie und der Landwirtschaft.[5]

Micromonosporaceae-Stämme wurden aus verschiedenen Lebens­räumen (Habitaten) isoliert, unter anderem aus Böden, Sedimenten, Meer- und Süßwasser, der Rhizosphäre und aus Pflanzengewebe.[5][10]

Die gegenwärtig akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN).[4]

Synonyme des Ordnungsnamens Micromonosporales:

  • Actinocatenisporales Salam et al. 2020
  • Phytomonosporales Salam et al. 2020
  • Actinoplanales Cavalier-Smith 2002
  • Micromonosporineae Stackebrandt et al. 1997

Synonyme des Familiennamens Micromonosporaceae:

  • Actinoplanaceae Couch 1955 (Approved Lists 1980)
  • Phytomonosporaceae Salam et al. 2020
  • Actinocatenisporaceae Salam et al. 2020

Gattungen der Micromonosporaceae:[4]

  • Amorphosporangium, „Ampullaria“ und Ampullariella wurden reklassifiziert als Actinoplanes.
  • Jishengella, Verrucosispora[11] und Xiangella wurden reklassifiziert als Micromonospora.
  • Planopolyspora wurde reklassifiziert als Catenuloplanes.

Nach phylogenetischen Analysen der 16S rRNA bilden durch die Referenzstämme vertretenen Mitglieder der Familie klar definierte Kladen. Die nächsten verwandten Familien sind die Glycomicetaceae und Jiangellaceae.[5]

Die folgende Phylogenie basiert auf einer Ganzgenomanalyse.[14][A. 2]

  
 Micromonosporales 

Actinocatenispora


  

Longispora


  
  

Catelliglobosispora


   

Hamadaea



  

Dactylosporangium


  
  

Catenuloplanes


  

Pseudosporangium


   

Actinoplanes




  

Asanoa


  

Salinispora


   

Micromonospora









 (Außengruppe

Glycomycetales



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Wikispecies: Micromonosporaceae – Artenverzeichnis
  1. Anteiso-Fettsäuren (Anteiso-fatty acids, aFA) enthalten eine ungerade Anzahl von Kohlenstoffatomen.[9]
  2. Actinorhabdospora, Allocatelliglobosispora, Allorhizocola, Catellatospora, Couchioplanes, Krasilnikovia, Luedemannella, Mangrovihabitans, Phytohabitans, Phytomonospora, Pilimelia, Planosporangium, Plantactinospora, Polymorphospora, Rhizocola, Rugosimonospora, Spirilliplanes und Virgisporangium sind in diesem phylogenetischen Baum nicht enthalten.

Einzelnachweise

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  1. Olga Genilloud: Order XI Micromonosporales ord. nov.. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Hrsg.: Michael Goodfellow, Peter Kämpfer, Martha E. Trujillo, Ken-ichiro Suzuki, Wolfgang. Ludwig, William B. Whitman, Hans-Jürgen Busse, Ken-ichiro Suzuki, Wolfgang Ludwig. 2nd Auflage. Band 5. Springer, New York 2012, S. 1035; doi:10.1007/978-0-387-68233-4, ResearchGate (englisch).
  2. L. V. Kalakoutskii: Nikolai Alexandrovitch Krasil'nikov 1896-1973. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 25, Nr. 4, 1. Oktober 1975; doi:10.1099/00207713-25-4-393.
  3. NCBI Taxonomy Browser: Micromonosporaceae, Details: Micromonosporales Genilloud 2015 (family).
  4. a b c LPSN: Family Micromonosporaceae Krassilnikov 1938 (Approved Lists 1980).
  5. a b c d e f Martha E. Trujillo, Kui Hong, Olga Genilloud: The Family Micromonosporaceae. In: The Prokaryotes, S. 499–569; doi:10.1007/978-3-642-30138-4_196.
  6. H. R. Perkins: 2,6-Diamino-3-Hydroxypimelic Acid in Microbial Cell Wall Mucopeptide. In: Nature, Band 208, 27. November 1965, S. 872–873; doi:10.1038/208872a0 (englisch).
  7. (2R,3S,6S)-2,6-diamino-3-hydroxy-diaminopimelate. Auf: MetaNetX.
  8. 3-Hydroxy-(meso-2,6-diaminopimelic acid). Auf: BenchChem.
  9. Anteiso 15:0 Fatty Acid. Auf: Merck Sigma-Aldrich.
  10. GBIF: Micromonosporaceae family.
  11. a b c WoRMS: Micromonosporaceae (family).
  12. Nathan A. Magarvey, Jessica M. Keller, Valerie Bernan, Martin Dworkin, David H. Sherman: Isolation and Characterization of Novel Marine-Derived Actinomycete Taxa Rich in Bioactive Metabolites. In: Applied and Environmental Microbiology. 70. Jahrgang, Nr. 12, 1. Dezember 2004, S. 7520​–7529, doi:10.1128/AEM.70.12.7520-7529.2004, PMID 15574955, PMC 535209 (freier Volltext), bibcode:2004ApEnM..70.7520M (englisch).
  13. Feiyu Jia, Chongxi Liu, Xiangjing Wang, Junwei Zhao, Qianfeng Liu, Ji Zhang, Ruixia Gao, Wensheng Xiang: Wangella harbinensis gen. nov., sp. nov., a new member of the family Micromonosporaceae. In: Antonie van Leeuwenhoek, Band 103, Nr. 2, 2013, S. 399–408; doi:10.1007/s10482-012-9820-1, PMID 23011010, Epub: 26. September 2012 (englisch).
  14. Imen Nouioui, Lorena Carro, Marina García-López, Jan P. Meier-Kolthoff, Tanja Woyke, Nikos C. Kyrpides, Rüdiger Pukall, Hans-Peter Klenk, Michael Goodfellow, Markus Göker: Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria. In: Frontiers in Microbiology, Band 9., 22. August 2018, S. 2007; doi:10.3389/fmicb.2018.02007, PMID 30186281, PMC 6113628 (freier Volltext) (englisch).