Potato-Spindle-Tuber-Viroid

Potato-Spindle-Tuber-Viroid
Viroid der Familie Pospiviroidae
Systematik
Klassifikation: Viroide Ordnung: nicht klassifiziert Familie: Pospiviroidae Gattung: Pospiviroid Art: Potato spindle tuber viroid
Taxonomische Merkmale
Genom: ssRNA zirkulär Symmetrie: kein Kapsid Hülle: keine Hülle
Wissenschaftlicher Name
Potato spindle tuber viroid
Kurzbezeichnung
PSTVd
Links
ICTV Taxon History: 201854527 NCBI Taxonomy: 12892 NCBI Reference: V01465 ViralZone (Expasy, SIB): 6916 (Familie)

Das Potato Spindle Tuber Viroid (PSTVd, selten als Kartoffelspindelknollen-Viroid bezeichnet) ist ein Krankheitserreger bei Pflanzen und gehört zu den Viroiden. Als solches hat der Erreger weder eine Hülle noch Proteinstrukturen, sondern besteht lediglich aus einem nackten Molekül RNA, das durch spezifische Faltung und Ausbildung von Haarnadelstrukturen gegen überall gegenwärtige RNasen resistent ist.

Wirken

Das PSTVd befällt Kartoffelpflanzen und verursacht bei ihnen die Pflanzenkrankheit Spindelknollensucht, einen durch die Krankheit bedingten typisch spindelförmigen Wuchs der Kartoffelknollen. Die Mechanismen der Infektiosität und der Pathogenität sind bis jetzt noch nicht bekannt. Das PSTVd wurde 1971 von Theodor O. Diener am Plant Virology Laboratory, United States Department of Agriculture, Beltsville, Maryland, entdeckt und charakterisiert.

Genomsequenz des PSTVd

Das PSTVd besteht aus 359 Ribonukleotiden und hat folgende Sequenz:

1 CGGAACUAAA CUCGUGGUUC CUGUGGUUCA CACCUGACCU CCUGAGCAGA AAAGAAAAAA 61 GAAGGCGGCU CGGAGGAGCG CUUCAGGGAU CCCCGGGGAA ACCUGGAGCG AACUGGCAAA 121 AAAGGACGGU GGGGAGUGCC CAGCGGCCGA CAGGAGUAAU UCCCGCCGAA ACAGGGUUUU 181 CACCCUUCCU UUCUUCGGGU GUCCUUCCUC GCGCCCGCAG GACCACCCCU CGCCCCCUUU 241 GCGCUGUCGC UUCGGCUACU ACCCGGUGGA AACAACUGAA GCUCCCGAGA ACCGCUUUUU 301 CUCUAUCUUA CUUGCUUCGG GGCGAGGGUG UUUAGCCCUU GGAACCGCAG UUGGUUCCU

Sekundärstruktur der PSTVd-RNA

Literatur

• Stefan Andreas Gräf: Bildung metastabiler RNA-Strukturen durch sequentielle Faltung von Viroid-Transkripten. Düsseldorf 1999, Kapitel Eigenschaften der Viroidstruktur. (archive.org – Diplomarbeit, Universität Düsseldorf). 
• T. O. Diener: Potato spindle tuber “virus”: IV. A replicating, low molecular weight RNA. In: Virology. Band 45, Nr. 2, 1971, S. 411–428, doi:10.1016/0042-6822(71)90342-4. 
• T. O. Diener, D. R. Smith: Potato spindle tuber viroid. VI. Monodisperse distribution after electrophoresis in 20 per cent polyacrylamide gels. In: Virology. Band 46. Nr. 2, 1971, S. 498–499, doi:10.1016/0042-6822(71)90342-4, PMID 5130125.
• T. O. Diener, D. R. Smith, M. J. O’Brien: Potato spindle tuber viroid. VII. Susceptibility of several solanaceous plant species to infection with low molecular-weight RNA. In: Virology. Band 48, Nr. 3, 1972, S. 844–846, doi:10.1016/0042-6822(72)90166-3, PMID 5031507.
• T. O. Diener: Potato spindle tuber viroid. 8. Correlation of infectivity with a UV-absorbing component and thermal denaturation properties of the RNA. In: Virology. Band 50, Nr. 2, 1972, S. 606–609, doi:10.1016/0042-6822(72)90412-6, PMID 4636118.