Allorhizobium

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Allorhizobium
Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Abteilung: Pseudomonadota
Klasse: Alphaproteobacteria
Ordnung: Hyphomicrobiales
Familie: Rhizobien (Rhizobiaceae)
Gattung: Allorhizobium
Wissenschaftlicher Name
Allorhizobium
de Lajudie et al. 1998[1][2]

Allorhizobium ist eine Gattung gramnegativer Bodenbakterien.[3][4] Einige Allorhizobium-Arten leben in einer stickstofffixierende Endosymbiose in den Wurzeln von Leguminosen, während von anderen bekannt ist, dass sie Kronengallen oder andere Pflanzenkrankheiten verursachen.

Nach der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) ist die Taxonomie der Gattung mit Stand 7. Januar 2024 wie folgt:[2]

Familie Rhizobiaceae Conn 1938

  • Gattung Allorhizobium de Lajudie et al. 1998[1]
    Gattung [Xaviernesmea Kuzmanović et al. 2022,
    Gattung AffinirhizobiumMa et al. 2023]
    • Spezies Allorhizobium ampelinum Kuzmanović et al. 2022 [Allorhizobium vitis_A (GTDB)]
    • Spezies Allorhizobium borbori (Zhang et al. 2011) Mousavi et al. 2016[A. 1]
    • Spezies Allorhizobium oryzae (Peng et al. 2008) Mousavi et al. 2016 [Xaviernesmea oryzae (Peng et al. 2008) Kuzmanović et al. 2022, Pararhizobium oryzae (GTDB)]
    • Spezies Allorhizobium oryziradicis (Zhao et al. 2017) Lin et al. 2020 [„Allorhizobium oryziradicis(Zhao et al. 2017) Hoerdt et al. 2020, Rhizobium oryziradicis Zhao et al. 2017 (NCBI)]
    • Spezies Allorhizobium pseudoryzae (Zhang et al. 2011) Mousavi et al. 2016
    • Spezies Allorhizobium sonneratiae Li et al. 2023 [Allorhizobium sp023700755 (GTDB)]
    • Spezies Allorhizobium taibaishanense (Yao et al. 2012) Hördt et al. 2020 [„Allorhizobium taibaishanense(Yao et al. 2012) Mousavi et al. 2015]
    • Spezies Allorhizobium terrae Lin et al. 2020
    • Spezies Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 (Typus)[1]
    • Spezies Allorhizobium vitis (Ophel & Kerr 1990) Mousavi et al. 2016 [„Allorhizobium vitisBrenner et al. 2005]
Mögliche weitere Mitglieder der Gattung nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI):[5]
  • Spezies Allorhizobium sp. 7A-195
  • Spezies Allorhizobium sp. Av2
  • Spezies Allorhizobium sp. CTOTU49807
  • Spezies Allorhizobium sp. CTOTU50464
Nach der Genome Taxonomy Database (GTDB) gehören folgende bisher anderen Gattungen zugeordnete Spezies zu Allorhizobium:[6]
  • Spezies Allorhizobium albertimagni [Agrobacterium albertimagni] (mit Stamm AOL15)
  • Spezies Allorhizobium cremeum [Rhizobium cremeum] (mit Stamm W16)
  • Spezies Allorhizobium daejeonense [Rhizobium daejeonense] (mit Stamm L61)
  • Spezies Allorhizobium desertarenae [Peteryoungia desertarenae] (mit Stamm ADMK78)
  • Spezies Allorhizobium ferrooxidans [Ciceribacter ferrooxidans] (mit Stamm F8825)
  • Spezies Allorhizobium glycinendophyticum [Rhizobium glycinendophyticum] (mit Stamm CL12)
  • Spezies Allorhizobium halophytocola [Rhizobium halophytocola] (mit Stamm DSM 21600)
  • Spezies Allorhizobium ipomoeae [Peteryoungia ipomoeae] (mit Stamm shin9-1)
  • Spezies Allorhizobium lividum [Ciceribacter lividus] (mit Stamm DSM 25528)
  • Spezies Allorhizobium naphthalenivorans [Ciceribacter naphthalenivorans] (mit Stamm NBRC 107585)
  • Spezies Allorhizobium naphthalenivorans_A [Ciceribacter naphthalenivorans] (mit Stämmen T2.26MG-112.21 und T2.30D-1.1)
  • Spezies Allorhizobium rhizophilum [Rhizobium rhizophilum] (mit Stamm 7209-2)
  • Spezies Allorhizobium rosettiformans [Rhizobium rosettiformans W3] (mit Stamm W3)
  • Spezies Allorhizobium selenitireducens [Ciceribacter selenitireducens ATCC BAA-1503] (mit Stamm ATCC BAA-1503)
  • Spezies Allorhizobium thiooxidans [Ciceribacter thiooxidans] (mit Stamm F43B)
  • Spezies Allorhizobium wuzhouense [Rhizobium wuzhouense] (mit Stamm W44)

Verschiebungen nach der LPSN:[2]

  • Spezies „Allorhizobium paknamense(Kittiwongwattana & Thawai 2013) Mousavi et al. 2015Rhizobium paknamense Kittiwongwattana & Thawai 2013

Die GTDB führt als Abspaltungen Allorhizobium vitis_A, B, D, E, F.[6]

Die Zuordnung vieler Spezies zur Gattung ist also noch umstritten. Weitgehende Einigkeit besteht aber bei der Typusart Allorhizobium undicola sowie Allorhizobium terrae und Allorhizobium vitis, mit Einschränkungen bei Allorhizobium sonneratiae [Allorhizobium sp023700755[6]] und Allorhizobium ampelinum [Allorhizobium vitis_A[6]].

Der Gattungsname Allorhizobium ist abgeleitet von altgriechisch άλλος allos, deutsch ‚anders‘, ‚verschieden‘ und neulateinisch Rhizobium, einer verwandten, aber phylogenetisch anderen Bakteriengattung. Allorhizobium bedeutet daher eine von Rizobium verschiedene Bakteriengattung.[2]

  1. GTDB: Rhizobium_B borbori [„Ectorhizobium borbori(Zhang et al. 2011) Ma et al. 2023]

Einzelnachweise

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  1. a b c Philippe de Lajudie, Etike Laurent-Fulele, Anne Willems, Urbain Torck, Renata Coopman, Matthew D. Collins, Karel Kersters, Bernard Dreyfus, Monique Gillis: Allorhizobium undicola gen. nov., sp. nov., nitrogen-fixing bacteria that efficiently nodulate Neptunia natans in Senegal. In: International Journal of Systematic Bacteriology, Band 48, Nr. 4, 1. Oktober 1998, S. 1277–1290, doi:10.1099/00207713-48-4-1277, PMID 9828428, ResearchGate: 282169308 (englisch).
  2. a b c d LPSN: Genus Allorhizobium de Lajudie et al. 1998.
  3. Seyed Abdollah Mousavi, Janina Österman, Niklas Wahlberg, Xavier Nesme, Céline Lavire, Ludovic Vial, Lars Paulin, Philippe de Lajudie, Kristina Lindström: Phylogeny of the Rhizobium–AllorhizobiumAgrobacterium clade supports the delineation of Neorhizobium gen. nov. In: Systematic and Applied Microbiology, Band 37, Nr. 3, Mai 2014, S. 208–215; doi:10.1016/j.syapm.2013.12.007, PMID 24581678 (englisch).
  4. Seyed Abdollah Mousavi, Anne Willems Xavier Nesme, Philippe de Lajudie, Kristina Lindström: Revised phylogeny of Rhizobiaceae: proposal of the delineation of Pararhizobium gen. nov., and 13 new species combinations. In: Systematic and Applied Microbiology, Band 38, Nr. 2, März 2015, S. 84–90, doi:10.1016/j.syapm.2014.12.003, PMID 25595870 (englisch).
  5. NCBI Taxonomy Browser: Allorhizobium, Details: Allorhizobium de Lajudie et al. 1998?
  6. a b c d GTDB: Allorhizobium (genus).