Die Håndboldligaen 2012/13 (offiziell: Jack & Jones Ligaen) war die 77. Spielzeit der Håndboldligaen, der höchsten Liga im dänischen Herrenhandball. Die Håndboldligaen fand ohne den Titelverteidiger AG København statt, der vor Saisonbeginn Insolvenz anmeldete.[1] Am Saisonende feierte Aalborg Håndbold die Meisterschaft.
Die Mannschaften auf den ersten acht Plätzen wurden in zwei Gruppen eingeteilt. Die Mannschaften auf Platz eins bis vier bekamen hierbei Zusatzpunkte zugesprochen (zwei Punkte für Platz eins und zwei, je einen für Platz drei und vier), die sie in die Runde mitnehmen dürfen. Die Erst- und Zweitplatzierten dieser beiden Gruppen spielten im Halbfinale über Kreuz gegeneinander.
Gemeinsam mit den Mannschaften auf Platz zwei, drei und vier der 1. Division spielten die fünf Mannschaften auf Platz neun bis dreizehn um freie Plätze in der ersten Liga 2013/14. Dabei wurden die Mannschaften nach Vorrundenabschluss auf zwei Gruppen mit je 4 Mannschaften aufgeteilt. Die beiden ersten dieser Runde qualifizierten sich für die Håndboldligaen 2013/14, während die beiden Dritten gegeneinander den letzten freien Platz in der Liga ausspielten. Die besser platzierten Mannschaften der Hauptrunde erhielten auch hier bis zu zwei Bonuspunkte.
Skive fH blieb somit in der Håndboldligaen. Viborg HK verzichtete kurz nach dem Saisonende auf seinem Startplatz für die kommende Spielzeit. Dieser freie Startplatz wurde dem Zwangsabsteiger Nordsjælland Håndbold zugesprochen.[3]