Huber gab am 3. Januar 1988 in Innsbruck sein Debüt im Skisprung-Weltcup. Am 16. Februar 1990 konnte Huber in Predazzo mit dem 14. Platz von der Normalschanze erstmals Weltcup-Punkte gewinnen. Beim Skifliegen am Kulm erreichte er am 24. Februar 1991 mit dem 7. Platz die höchste Einzelplatzierung seiner Karriere. Er beendete die Saison 1990/91 auf dem 28. Platz in der Weltcup-Gesamtwertung. In der Skiflug-Wertung belegte er den 15. Platz. Ab Dezember 1991 sprang Huber parallel im Skisprung-Continental-Cup. In der Continental-Cup-Saison 1993/94 konnte er dabei den 3. Platz in der Gesamtwertung erreichen. Im Weltcup gelang ihm im März 1994 in Lahti noch einmal ein Punktegewinn. 1995 beendete Huber seine aktive Skisprungkarriere.