Bahnlinien verlaufen im Kreis fast ausschließlich entlang der Rheintalsohle. Lediglich eine S-Bahnlinie zweigt bis nach Zell im Wiesental ab. Der Badische Bahnhof in Basel liegt als bahntechnischer Knotenpunkt außerhalb der Landesgrenze. Insgesamt verlaufen etwa 45 Autobahnkilometer durch das Kreisgebiet.
Katzenbergtunnel | Rangierbahnhof Weil am Rhein