Vorlage:Infobox Virus/Doku

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Alle Parameter: 

<!-- Zu Informationen zum Umgang mit dieser Vorlage siehe bitte [[Wikipedia:Viroboxen]]. -->
{{Infobox Virus
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Nur die wichtigsten Parameter: 

<!-- Zu Informationen zum Umgang mit dieser Vorlage siehe bitte [[Wikipedia:Viroboxen]]. -->
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Parameter[Quelltext bearbeiten]

Parameter Beschreibung Möglicher Wert / Mögliche Werte
Name Deutscher Name des Virustaxons/Virus Nanoviriden / Gelbfieber-Virus / Bakteriophage T2
Wiss_Name Wissenschaftlicher Name, wenn möglich nach ICTV (ersatzweise nach NCBI), normalerweise kursiv und in englischer Sprach­um­gebung; Standardwert ist der niedrigste spezifizierte Rang (stan­dard­mäßig automatisch kursiv) Yellow fever virus / Enterobacteria phage T2 / nicht festgelegt
Wiss_KurzName Wissenschaftlicher Kurzname, wenn möglich nach ICTV YFV
Bild Bild (ggf. Schemazeichnung) eines (Mit­glieds-)Virus VirusBild.jpg
Bild_größe Größe des Bildes 250px (Standardwert: 200px)
Bild_legende Legende des Bildes (ohne: keine Legende) ohne / [[Virion|Virusteilchen]] von X (Standardwert: Name)
Klassifikation Klassifikation (optional, wird automatsch querverwiesen): Viren oder subvirale Partikel, deren Taxonomie vom ICTV verwaltet wird. Viren (Standardwert) / Viroide / Satelliten / Viriforme
ohne_Rang nur für unbestätigte Ver­wandt­schafts­gruppen:
Ersetzt die Bezeichnungen für die ge­lis­teten Ränge (etwa Unterart/Sub­spezies, Untergattung/Subgattung, …) durch den Text ‚ohne Rang‘		 Rang / Rang1, Rang2,… / (Standardwert: leer)
Realm Realm (automatisch kursiv) Realm / [[Realm]] / nicht klassifiziert
Subrealm Subrealm (automatisch kursiv) Subrealm / [[Subrealm]] / nicht klassifiziert
Reich Reich (automatisch kursiv) Reich / [[Reich]] / nicht klassifiziert
Subreich Unterreich (wird automatisch kursiv) Subreich / [[Subreich]] / nicht klassifiziert
Phylum Phylum (automatisch kursiv) Phylum / [[Phylum]] / nicht klassifiziert
Subphylum Subphylum (automatisch kursiv) Subphylum / [[Subphylum]] / nicht klassifiziert
Klasse Klasse (automatisch kursiv) Klasse / [[Klasse]] / nicht klassifiziert
Subklasse Unterklasse (automatisch kursiv) Subklasse / [[Subklasse]] / nicht klassifiziert
Ordnung Ordnung (automatisch kursiv) Ordnung / [[Ordnung]] / nicht klassifiziert
Subordnung Unterordnung (automatisch kursiv) Subordnung / [[Subordnung]] / nicht klassifiziert
Familie Familie (automatisch kursiv) Familie / [[Familie]] / nicht klassifiziert
Subfamilie Unterfamilie (automatisch kursiv) Subfamilie / [[Subfamilie]] / nicht klassifiziert
Gattung Genus (Gattung) (automatisch kursiv) Gattung / [[Gattung]] / nicht klassifiziert
Subgattung Subgenus (Untergattung) (automatisch kursiv) Subgattung / [[Subgattung]] / nicht klassifiziert
Spezies Spezies (Art) (automatisch kursiv) Spezies / [[Spezies]]
Subspezies Subspezies/Unterart (stan­dardmäßig auto­matisch kursiv) Subspezies / [[Subspezies]]
kursiv Für den Fall, dass unter Subspezies ein Stamm oder Isolat angegeben wird, der nicht kursiv angezeigt werden soll. Wirkt auf die angezeigte Unterart, den Standard für die Bildunterschrift, den angezeigten wis­senschaftlichen Namen, und das Artikel­lemma (wenn es mit letzterem über­einstimmt) ja (Standardwert) / nein
Genom Kurzbeschreibung des Virusgenoms [[Polarität (Virologie)|(+ / -)ssRNA]] / dsRNA / ssRNA-RT / [[Polarität (Virologie)|(+ / - / +/-)ssDNA]] / dsDNA / dsDNA-RT
linear / zirkulär
segmentiert / unsegmentiert
Baltimore Klassifikation nach Baltimore (keine rö­mi­schen Zahlen, für gruppenübergreifende Taxa mehrere Angaben/Bereiche ok.) 4 / 3, 4, 5 / 3 – 5
Kapsid Kapsidsymmetrie
keine: pleomorph/keine Symmetrie
ohne/keines: kapsidlos		 ikosaedrisch / helikal / komplex / keine / ohne / keines / <frei wählbar>
Virushülle Virushülle vorhanden oder nicht vorhanden / keine
NCBI_Tax NCBI Taxonomy ID oder Name;
für spezielle Fälle (wie HIV) können mehrere Angaben durch Komma oder Strichpunkt getrennt werden, Kurzname optional jeweils hinter ID/Name in Klam­mern. srchmode: 1=vollst. Name, 2=Wildcards, 3=Token-Set, 4=phonetischer Name; lvl: Verzweigungstiefe (Rangstufen); Details siehe NCBI: Linking to the NCBI Taxonomy Database.		 10335 / 3044427&lvl=4 /
Cedratvirus&srchmode=3 (alle), 1903‍266 (A11) / 11676 (HIV-1), 11709 (HIV-2)
NCBI_Ref NCBI Reference Genome;
mehrere Angaben und optionaler Kurzname wie oben durch Komma trennen, Belege und Anmerkungen am Ende möglich (ref-Tag)		 EU154348.1 / AF033819 (HIV-1), KP890355.1 (HIV-2)
ViralZone ViralZone (Expasy, SIB) ID,
optional mit Parametern für Zielseite (wird nicht angezeigt);
mehrere Angaben und optionaler Kurzname durch Komma trennen		 220 / 220?outline=all_by_species#tab6 / 7 (HIV-1), 64 (HIV-2)
ICTV_Tax ICTV Taxon History Id;
mehrere Angaben und optionaler Kurzname durch Komma trennen. Optional: Parameter taxon_name		 2018‍53121 / 202214301&taxon_name=Atroposvirales / 2018‍55030 (HIV-1), 2018‍55031 (HIV-2)
ICTV obsolet (veraltet und wird nicht mehr angezeigt)

Als wissenschaftlicher Name sollte bei ICTV-bestäigten Taxa die offizielle ICTV-Bezeichnung angegeben werden, bei unbestätigten Taxa ersatzweise der NCBI-Name (in doppelten Anführungszeichen). Es erfolgt eine automatische Kursivsetzung, die für Bezeichner unterhalb Art/Spezies („Subspezies“) abgeschaltet werden kann. Dasselbe gilt für die taxonomischen Ränge von Realm bis Spezies (bzw. Subspezies). Lediglich das Feld Name ist derzeit für einen deutschen Namen vorgesehen.

Wenn unbedingt erforderlich, kann die Kursivsetzung für einen einzelnen taxonomischen Rang (Spezies aufwärts) abgescahltet werden mit:

  • <span style="font-style:normal;">Xyz-Viren</span>

oder (einfacher, aber weniger sicher – die zweifachen Einfach-Anführungszeichen wirken als Umschalter):

  • ''Xyz-Viren''</span>

Hiweise zum Herausfinden der ICTV/NCBI/ViralZone-IDs:

  • Wikidata: Taxon suchen – Abschnitt „Identifiers“
  • ICTV: ICTV Taxonomy – Suche (Teilstring möglich), ggf. „all ICTV releases“ aktivieren – in der Trefferliste „View“ auf den neuesten passenden Eintrag – in der angezeigten und hervorgehobenen Zeile gant rrechts auf „history“ gehen. Die ID steht in der Adresse der angezeigten Webseite ganz rechts.
  • ICTV (nur Spezies): Master Species Lists – die neueste Excel-Liste anzeigen/downloaden - das letzte Datenblatt ist die Liste selbst – dort suchen – die letzte Spalte ganz rechts beinhaltet die Adresse der „history“ (wie oben).
  • NCBI (Taxon ID): Taxonomy Browser – Suchen (verschiedene Suchstrategien möglich) – falls Trefferliste angezeigt das gewünschte Taxon auswählen – in der Detailansicht werden die ID, Rang, Synonme etc. angezeigt. Für Spezialzwecke unterstützt die Vorlage neben der Taxon ID auch die anderen Suchstrategien.
  • NCBI (Reference): Wenn man in Originalartikeln oder der ICTV-Dokumentation nict fündig wird, findet man Zugriffsnummeren (Accession Numbers) für Genom und/oder Proteom über den NCBI Taxonomy Browser in der Detailansicht (s. o.) – Box rechts – Nucleotide bzw. Protein
  • ViralZone: Expasy ViralZone – für die Ränge bis hoch zu Familie führt man die Suche aus (eigene Seiten für Spezies oder darunter gibt es nur in besonders prominenten Fällen). Für die höheren Ränge benutzt man besser die oberen Knöpfe mit den Baltimore-Gruppem (dsDNA, ssDNA usw.), sollte aber keine zu hohen Erwartunegn haben. Interessant auch Viral exotoxin, Modulation of host virulence by virus und Viral latency. Achtung: Manche Seiten haben mehrere Datenblätter, die Vorlage unterstützt das direkte Ansteuern derselben wenn das erste (d. h. linke) leer ist.

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