Straboviridae

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Zur Navigation springen Zur Suche springen
Straboviridae

Schemazeichnung eines
Virions von Enterobacteria-Phage T4, Gattung Tequattrovirus (Querschnitte und Seitenansicht)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria
Reich: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Klasse: Caudoviricetes
Ordnung: incertae sedis
Familie: Straboviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Myoviren)
Wissenschaftlicher Name
Straboviridae
Links
NCBI Taxonomy: 2946170
ViralZone (Expasy, SIB): 10344
ICTV Taxon History: 202213666

Straboviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Bakterien infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen genannt). Die Familie wurde im März/April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) eingerichtet.[1]

Forschungsgeschichte[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Phagen, die histotrophe Bakterien[A. 1] infizieren, zusammenzufassen – einschließlich der bestehenden Unterfamilien Tevenvirinae, Emmerichvirinae und Twarogvirinae. Um Monophylie herzustellen, wurden gleichzeitig die folgenden Gattungen aus der Unterfamilie Tevenvirinae ausgegliedert: Schizotequatrovirus, Slopekvirus, Pseudotevenvirus und Krischvirus . Die T4-ähnlichen Cyanophagen wurden dagegen in der Familie Kyanoviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den damals neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.[2]

Beschreibung[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Viruspartikel (Virionen) der Straboviridae haben die für Mitglieder der Caudoviricetes typische Kopf-Schwanz-Struktur, das Kapsid des Kopfes hat keine Hülle. Der längliche ist 120 nm lang und 86 nm breit. Das Kapsid hat eine längliche (d. h. nicht-isometrische) ikosaedrische Symmetrie T=13 Q=21 und besteht aus 152 Kapsomeren. Der Schwanz ist kontraktil und hat 6 lange Endfasern, dazu 6 kurze Stacheln (Spikes) und eine kleine Grundplatte.[3][2]

Genom und Proteom[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Straboviridae haben ein lineares dsDNA-Genom mit einer Länge von etwa 169 kbp (Kilobasenpaaren), das für etwa 300 Proteine kodiert. Die Gene werden von Operons transkribiert. Sie kodieren u. a. für folgende Gene:[3][A. 2]

Replikation[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Replikation der Straboviridae findet im Zytoplasma der Wirtszellen statt. Die einzelnen Schritte sind wie folgt:[3]

  1. Adsorption: Die Viruspartikel der Phagen heften sich über ihre Schwanzfasern an die Zielzelle an.
  2. Das Virus-Exolysin (Murein-Hydrolase)[4] baut die Zellwand lokal ab.
  3. Injektion der Virus-DNA in das Zytoplasma der Wirtszelle durch Kontraktion der Schwanzscheide.
  4. Transkription und Translation von „frühen“ Genen.
  5. Replikation des DNA-Genoms. Transkription und Translation von „späten“ Genen.
  6. Assembly: Aufbau eines leeren Prokapsids und Verpackung des Genoms.
  7. Zusammenbau der Virusschwanzfasern und des Virusschwanzes.
  8. Die reifen Virionen werden durch Lyse aus der Zelle freigesetzt.

Etymologie[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Bezeichnung der Familie Straboviridae verweist auf den griechischen Philosophen Strabon;[A. 3] der Suffix ‚-viridae‘ steht für Virusfamilien.[1][2]

Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Innere Systematik der Familie Straboviridae (Stand: 4. November 2023):

Familie Straboviridae (36 Gattungen)[5]

  • Unterfamilie: Emmerichvirinae
    • Gattung: Ceceduovirus (3 Spezies)
    • Gattung: Ishigurovirus (1 Spezies)
      • Spezies: Aeromonas-Virus 65 (wiss. Ishigurovirus osborne)
EM-Aufnahme zweier Virionen der Gattung Tequatrovirus
Escherichia-Phage T4, Gattung Tequatrovirus
  • Unterfamilie: Tevenvirinae[6]
    • Gattung: Dhakavirus (früher Js98virus)
    • Gattung: Gelderlandvirus (früher S16virus)
    • Gattung: Jiaodavirus (früher Jd18virus)
    • Gattung: Kagamiyamavirus
    • Gattung: Kanagawavirus
    • Gattung: Karamvirus (früher Cc31virus)
    • Gattung: Moonvirus
    • Gattung: Mosigvirus (früher Rb69virus)
    • Gattung: Mosugukvirus
    • Gattung: Roskildevirus
    • Gattung: Tegunavirus (früher Tg1virus)
    • Gattung: Tequatrovirus (früher T4virus, T4likevirus, T4-ähnliche Viren)[7] mit Tequatrovirus T4
    • ohne Gattungszuweisung (1 Spezies)
  • Unterfamilie: Twarogvirinae
    • Gattung: Acajnonavirus (1 Spezies)
    • Gattung: Hadassahvirus (2 Spezies)
    • Gattung: Lasallevirus (1 Spezies)
    • Gattung: Lazarusvirus (8 Spezies)
    • Gattung: Zedzedvirus (1 Spezies)
      • Spezies Acinetobacter-Virus ZZ1 (wiss. Zedzedvirus zz1)
  • ohne Unterfamilienzuweisung (15 Gattungen)
    • Gattung: Angelvirus (1 Spezies)
    • Gattung: Biquartavirus (1 Spezies)
    • Gattung: Bragavirus (3 Spezies)
    • Gattung: Carettavirus (1 Spezies)
    • Gattung: Chrysonvirus (1 Spezies)
    • Gattung: Cinqassovirus (2 Spezies)
      • Spezies: Aeromonas-Virus Aeh1 (wiss. Cinqassovirus aeh1)
    • Gattung: Gualtarvirus (1 Spezies)
    • Gattung: Jiangsuvirus (1 Spezies)
    • Gattung: Krischvirus (früher Rb49virus; früher zu Tevenvirinae, 6 Spezies)
      • Spezies: Escherichia-Virus ECD7 (wiss. Krischvirus ecd7)
      • Spezies: Escherichia-Virus GEC3S (wiss. Krischvirus gec3s)
      • Spezies: Escherichia-Virus JSE (wiss. Krischvirus jse)
      • Spezies: Escherichia-Virus phi1 (wiss. Krischvirus georgiaone)
      • Spezies: Escherichia-Virus RB49 (wiss. Krischvirus RB49)
    • Gattung: Mylasvirus (ausgegliedert aus Schizotequatrovirus, 1 Spezies)
      • Spezies Vibrio-Virus nt1 (wiss. Mylasvirus persius), mit
        • Vibrio-Phage nt-1
    • Gattung: Nanhuvirus (1 Spezies)
      • Spezies Nanhuvirus LPCS28, mit
        • Cronobacter-Phage LPCS28
    • Gattung: Pseudotevenvirus (9 Spezies)
      • Spezies: Escherichia-Virus RB16 (wiss. Pseudotevenvirus RB16)
      • Spezies: Escherichia-Virus RB43 (wiss. Pseudotevenvirus RB43)
    • EinVirion der Gattung Schizo­tequatro­virus
      Virionen des Stammes Vibriophage ϕpp2 der Spezies Schizo­tequatro­virus KVP40
      Gattung: Schizotequatrovirus (früher Schizot4virus, Schizot4likevirus; früher zu Tevenvirinae; 3 Spezies),[8] mit
      • Spezies: Vibrio-Virus KVP40 (wiss. Schizotequatrovirus KVP40), mit
        • Vibrio-Phage KVP40 (Typusstamm), mit
        • Vibrio-Phage phi-pp2 (alias Vibriophage ϕpp2)
      • Spezies: Vibrio-Virus ValKK3 (wiss. Schizotequatrovirus valkk3)
      • Spezies: Vibrio-Virus VH7D (wiss. Schizotequatrovirus vh7d), mit
        • Vibrio-Phage VH7D
    • Gattung: Slopekvirus (früher Kp15virus, 5 Spezies)[A. 4]
      • Spezies: Enterobacter-Virus Eap3
      • Spezies: Klebsiella-Virus KP15 (wiss. Slopekvirus kp15, ehem. Typus)[9]
      • Spezies: Klebsiella-Virus KP27 (wiss. Slopekvirus kp27)
      • Spezies: Klebsiella-Virus Matisse (wiss. Slopekvirus matisse)
      • Spezies: Klebsiella-Virus Miro ???
      • Spezies: Klebsiell-Virus PMBT1, mit ???
        • Klebsiella-Phage P-KP2
        • Klebsiella-Phage PMBT1
        • Klebsiella-Phage vB_KpnM_M1 alias Phage vB_Kp M1[10][9]
    • Gattung: Tulanevirus (früher Secunda5virus, 8 Spezies)
      • Spezies Aeromonas-Virus 25 (wiss. Tulanevirus bteighttwo), mit
        • Aeromonas-Phage 25 (engl. Aeromonas phage 25)

Wirtsspektrum[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Wirte der Straboviridae sind Gammaproteobakterien, hauptsächlich aus der Ordnung Enterobacterales, sowie einiger anderer. Dazu gehören:[A. 5][11]

Anmerkungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ Unter histotrophen (oder histiotrophen) Bakterien werden solche verstanden, die im Gewebe (insbes. von Tieren wie den Landwirbeltieren) leben und sich dort auf üblicherweise deren Kosten (parasitisch) ernähren, vgl. Histiotrophe.
  2. ↑ In Klammern sind die UniProt-IDs angegeben.
  3. ↑ Der Zusammenhang ist unklar.[1]
  4. ↑ Die Gattung Slopekvirus nicht zu verwechseln mit der Unterfamilie Slopekvirinae in Familie Autographiviridae
  5. ↑ siehe § Systematik.

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ a b c ICTV: Taxon Details: Family: Straboviridae.
  2. ↑ a b c Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
  3. ↑ a b c SIB: Straboviridae. Auf: Expasy: ViralZone.
  4. ↑ SIB: Degradation of host peptidoglycans during virus entry. Auf: Expasy: ViralZone.
  5. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  6. ↑ SIB: Tevenvirinae.
  7. ↑ SIB: Tequatrovirus syn. T4virus und T4likevirus.
  8. ↑ SIB: Schizotequatrovirus, syn. Schizot4likevirus. Auf: ViralZone.
  9. ↑ a b Anaïs Eskenaz et al.: Combination of pre-adapted bacteriophage therapy and antibiotics for treatment of fracture-related infection due to pandrug-resistant Klebsiella pneumoniae. In: Nature Communications, Band 13, Nr. 302, 18. Januar 2022; doi:10.1038/s41467-021-27656-z, insbes. Fig. 1 und Fig. 3. Dazu:
    Conor Fehly: Special Phage Therapy Clears a Patient's Resistant Infection After 798 Days. Aus sciencealert vom 21. Januar 2022.
  10. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Klebsiella phage vB_KpnM_M1 (species).
  11. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Straboviridae, Details: Straboviridae (family).
  12. ↑ LPSN: Order Moraxellales Liao et al. 2021.
Abgerufen von „https://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Straboviridae&oldid=243099615“